天然无序蛋白质的可药性分析

    虽然天然无序蛋白质一直被认为是具有重大发展潜力的药物靶标,但实际的成功例子却很少。这其中的重要原因是每个无序蛋白都存在大量的可能构象,其药物结合口袋的性质与有序蛋白很不一样。

 

    为了研究无序蛋白构象系综的结合口袋的特性,我们构建了两个无序蛋白的数据集(各包含37与17种蛋白),并分析了他们的结合口袋与可药性的特征。我们发现,对于同一蛋白,其结合口袋的数目在构象系综内具有非常宽的分布,其集合性质也与有序蛋白中的不同。例如,无序蛋白的结合口袋具有更大的表面积与体积,有更大概率是由单独一个片段构成的。最为重要的是,无序蛋白结合口袋的平均可药性比例为9%,几乎是有序蛋白(5%)的两倍。

 

    这个工作以封面文章的形式发表在《Protein Science》上:Yugang Zhang, Huaiqing Cao, and Zhirong Liu*, Binding cavities and druggability of intrinsically disordered proteins, Protein Sci. 24 (5), 688-705 (2015). 论文第一作者为大阳城8722(中国)有限公司2014届本科毕业生张宇罡(后赴康奈尔大学攻读博士学位)。

 

 

发表文章链接:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/pro.2641/abstract